A l’origine abbaye bénédictine probablement fondée par les seigneurs de Villebois au milieu du XI ème siècle, elle sera donnée à Cluny par l’évêque de Périgueux à la fin du XI ème siècle. Elle devient alors un prieuré dépendant de l’Abbaye de Cluny et dont dépendent à leur tour plusieurs prieurés et églises dans le diocèse de Périgueux. 

Suite à cette donation, d’importants travaux d’agrandissement sont réalisés dans le premier quart du XII ème siècle.

Le Prieuré subira les conflits entre les français et les anglais au XIV et XVème siècle : « La guerre de 100 ans« .

La paix revenue, au milieu du XV ème siècle la vie monacale reprend et d’importants travaux de restauration sont réalisés, en particulier une nouvelle galerie du cloître richement sculptée dont de nombreux restes nous sont parvenus.

A la fin du XVI ème siècle, l’abbaye-prieuré sera fortement endommagée lors des guerres de religions. 

Elle survivra avec quelques moines jusqu’à la fin du XVIII ème siècle où elle sera saisie comme bien national lors de la Révolution.

Exploitation agricole, carrière de pierre, elle est oubliée jusqu’en 1987 où un nouveau propriétaire la sauve et l’ouvre au public. Elle bénéficie alors d’une protection au titre de Monument Historique.